JCIに電凸してみた。対応してくれた担当者の話では

Q：リチウムをバスボートに搭載するのはNGですか？
A：リチウムがNGではなくてリチウムで船検を取得するにはしっかりとした
　　安全対策が必要で市販されている船舶では船検取得はできない

Q：鉛バッテリーで船検取得後、リチウムバッテリーに変更した場合は？
A：臨時検査受験義務違反か指定条件違反となり１年以下の懲役又は50万円以下の罰金

Q：JCIの支部によってリチウムに対する対応に違いがあるのでは
Ａ：JCI検査員全員に周知徹底できていない可能性があり、担当によって
　　見解が分かれている可能性はある

Q：JCIの公式見解として告知することは考えていないのか
Ａ：今のところ考えていないが、多くの問い合わせを頂いているので
　　今後、検討する可能性はある

だってさ。