今度は以下のような環境でテストしました。

[Win10x64]------[ LEDE Router ]-----[(ESXi6.0u3)-----(CentOS6.9 VM)----(Win7x64 VM)]
　　　　　　　　　　　　| ←----------PPPoE MTU 1454--------→ |
　　　　　StrongSwan| ←----------IPSec IKEv2 RSA---------------------→ | 標準VPN Client
　client|←-----------------------iperf3 -P 36 -d ---------------------→| server

CentOS6.9 x64 , rp-pppoe 3.10 (kernel mode)
LEDE 17.01.1 , StrongSwan 5.5.1
Windows7 Pro x64 , OS標準VPN Client, iperf3 3.1.3 win64
Windows10 Pro x64 , iperf3 3.1.3 win64


Win7 側で iperf3 -s
Win10側で iperf3 -c <iperf3 ip> -P 36 -t 65 -O 5 -d
　※iperf3のIPはWin7側LAN IPと VPN IPとで切り替えて 通常PPPoEの場合と、IPSecの場合とで測定。