2ドア3ドアの両方が公認を取っているならどちらを使っても良いし
エアロパーツも有り無し両方で公認を取ってあればそれもまた可能
(例:Gr.Aでは駄目だがJAF-N1だとR32GT-Rはメインのリアウィング無しで
 下のガーニーフラップだけの公認パターンもあり、主に富士で使われた)。

空力的には3ドアの方が有利な一方、剛性的には2ドアの方が有利なので
ラリー競技で2ドアが好まれたんでないかな。