シンジとマリの絡みがほぼ0なのにシンジがマリを選ぶのはおかしいってそれは新劇だけで考えるからだよ
シンジはループの全ての記憶を思い出してるから過去の世界でのマリとの関係も色々あってマリをパートナーに選んだだけ
庵野はそんな恋愛要素はエヴァの物語として重要じゃないから全部ふっ飛ばした