ここから先は推察だけど、「初級プログラミング」だけが取りざたされるのは提出率が見える唯一の科目だからなのであって、実は他の科目も単位取ってない学生が過半数を占めるのではないか。

入学はしたものの、その後面倒になって何もしていない人。
学校の特性からいってこういう人は多いだろう。
その結果、課題をクリアしてる率が異常に低く見えており、このような事態になったと考えられる。
なんか途中から論文書いてる気になってきた。