という事は、会社(労務士)の言ってることは嘘って事ですか？
会社に迷惑が掛かるようなら、いきなり労基署に行かずに話し合ってみたい
社長はあんま知識ないので、労務士の言いなりでしょうし

あと、労基署にチクったとかなると後々めんどくさい