軽車両って軽自動車のことではなく自転車とかリヤカーのことなのですが・・・。
搭乗中って乗ってましたということだから運転していなかったってことなのですが・・・。

一応「軽自動車」を「運転中」の事故として回答します。
労災適用です。
車の修理代は請求されたりされなかったり。
会社がどのような内容の自動車保険に入っているか次第です。
解雇になるのかどうかは知らないなあ。