閉鎖空間で自分にとってハルヒの存在は何か問いかけてるだろ
ただ同じクラスの女の子でもないし(ただのクラスメイトではないことを否定)ましてや神様でもない(不思議を運んでくれる存在ではないことも否定)
そして「メイド萌えだったの？」→「(お前の)ポニーテール萌えだ」
キス

これでキョンがハルヒに惚れてるのは普通に読み取れるから