>>82の説が正しい気がしてきた。
深夜のテンションに乗じて、長文レスを書いてみることとする。

さて。川沿いのベンチで朝比奈さんは、
「三年前。大きな時間震動が検出されたの。調査するために過去に飛んだ我々は驚いた。どうやってもそれ以上の過去に遡ることが出来なかったから」
…と語ったが、おそらく三年前の七夕が、時間震動のあった日とやらじゃないかね？

何だかんだで、その七夕の日にはるばる未来からやってきたキョンである。
そこでキョンは、当時ただの一般人だった中学生ハルヒと出会い、無自覚にも神的不思議パワーを与えたという仮説は如何だろうか？
晴れて神となったハルヒ。彼女が次に何をしたかというと、校庭にトンチキな巨大絵を描き上げたことである。
ネット上にSOS団マークをアップしただけでひと騒動を起こすのだから、ましてや巨大な地上絵が孕む情報量は計り知れないだろう。
それは瞬く間に全宇宙へ拡散し、後に長門曰く「情報フレア」、朝比奈さん曰く「時間震動」と呼ばれる、ビッグバンめいた現象となった。
結果、情報統合思念体は誕生し、長門は作り出され、古泉は超能力に目覚め、朝比奈さんらはそれ以上の過去に遡れなくなった…というわけである。

え？反論があるって？
情報統合思念体は宇宙開闢と同時に誕生したと、長門が言っていただろって？
それはあくまで長門の主観に基づいた認識に他ならない。
古泉は世界五分前仮説ならぬ世界三年前仮説を語ったが、同様に情報統合思念体もまた、それまでの記憶を持ったままある日当然世界に生まれたとしたら？
いかに長門と言えども否定出来まい。

どうだろうか。
深夜のノリで書き殴ったが、異論反論があったらウェルカム。