ヤマトと宇宙大作戦はちょっとスタンスの違う作品だと思う
共通してるのは宇宙船が出てきて未知の星を訪れる点ぐらい

個人的にはヤマトが参考にしたと思われるのは、昭和44年の東映の長編アニメ
「空飛ぶゆうれい船」かな
見かけはボロボロのゆうれい船が、実は内部は超近代メカで空も飛べるスーパーシップ
残骸戦艦大和の内部が実は最新鋭の宇宙戦艦ヤマトであるという点はイメージが共通
まあ事実は分からないが、ヒントぐらいは得たのではなかろうか