試したことないけど、想像で。

とりあえず重たそう。運ぶのが大変。
風通しが悪くなり、ケースの湿気が高くなって鳥にも餌にも悪そう。
透明な板=アクリルは掃除がしづらい。糞なんか付いたら落とすのが大変そう。
透明な板=アクリルはガラスなどと違って傷がつきやすく、数年で中が見えづらくなりそう。