男は男が嫌いですが、女性は女性と男性どちらに対しても寛容なので、あまり百合好き男子は敵視されないからかもと思ったり。
まぁ人数やジャンルの規模の違いが一番大きな要素でしょうけれど。

ただ百合好きな男性がほんとに百合を理解できているのかというのは微妙なので、百合属性の女性からは距離を置かれる場合もあるようです。

http://detail.chiebukuro.yahoo.co.jp/qa/question_detail/q1335928568