ubuntu 16にSoftEtherVPN Serverをインストールをしました。
LAN内でグローバルIPは割り当てられておらず、ルーターからポートフォワードでアクセスできるようにしています。

WindowsPC、SoftEtherVPNクライアントから接続すると、向こう側のLANのDHCPからのIPアドレスが付与され、インターネット接続やLANの資源が利用できています。

ただし、SoftEtherVPNサーバーをインストールしているUbuntu自身にはアクセスが出来ません。
現状は、LAN内のほかのLinxuにsshで入り、そこからubuntuのsshに接続している状況です。

WindowsPCからUbuntuに直接アクセスするには、どんなところをチェックすればいいでしょうか。

サーバー側の仮想ハブは、物理LANカードにつなげています。