Windows2003＋IIS6で、イントラWEBサイトを構築しているのですが
クライアントから、日本語名（2バイト文字）のファイル/ディレクトリを
「ディレクトリの参照」機能で見ようとすると、アドレス欄の表示が
「http://localhost/%e%f%/%e%f%・・」のように、URLエンコードされて
しまいます。

->asp.netの設定で、encode関連の設定を、shift_jisに直してみましたがNG・・

希望は、「http://localhost/あああ/いいい」などと、日本語で表示
したいのですが、サーバ側での設定方法があればお教え頂けないでしょうか。

なお前述の通り、使用目的は、”ディレクトリの参照”です。