weston(wayland)で試して分かったことを書いておく
他のgnome on waylandとかでも起こるのか分からない

デフォルト起動(GDK_BACKEND=wayland)でポップアップ内のアンカーからポップアップを出すとマウスポインターから離れた位置に表示される
2段目のポップアップを出したり消したりしていると挙動が不安定になってwestonごとフリーズor落ちる

XWaylandで起動(GDK_BACKEND=x11)して右クリックしながらポップアップ内にマウスポインターを動かすとポップアップ内容ではなくポップアップに隠れたスレビューに反応する
これはGTK2版も同じだった