あとこれが要因かはわかりませんんが
長時間(一時間とか)29.97fps記録したh264ファイルを
MP4Boxでfps29.97オプションで変換したMP4ファイルを再生すると
定期的に途中で割と大きなコマとびが発生している模様です

(ファイルの実情報と再生情報が合わなくて飛んでしまう?)