えーと、quilt管理のパッチがないってことはわかりました

そこでソースパッケージの

krita_4.0.4+dfsg-1.debian.tar.xz

を見て確認してみると特に変更点があるようには見えない（わかっていないだけかも）ので、
ソースパッケージにある

krita_4.0.4+dfsg.orig.tar.gz

と公式のtar.gzファイルを比べてみたらmd5sumをチェックするまでもなく
ファイルサイズ自体が違うものでした

ソースパッケージのorigファイルは上流と同じものでなくてはならないものだと思っていたので
ちょっと意外と言うか何と言うかな心境です