調べたところ他のエディションではこのスクリプトは間違っていない
3.0 Xfce/64ビット版だけのミスようだ
バグだと思う

バグの修正方法
/etc/kona/initsystem.shの13行目を
cp /etc/fonts.ubuntu /etc/fonts -> cp -R /etc/fonts.ubuntu /etc/fonts
システムアプデートをかけてしまった後に気づいたときは
/etc/fontsがないことを確認してから
sudo cp -R /etc/fonts.ubuntu /etc/fonts としてフォントを治す
その後/etc/kona/initsystem.shを上記のように修正する