WINEARCH=win64 winecfg
WINEARCH=win32 winecfg

両方やってみるとか？違ったらエラーが出ると思う。ただ、違うARCH指定して、
wine起動して.wine以下が壊れないかという心配はある。もしやるなら、.wine以下を
まるまるコピーしてからやるのをお勧めします。