要は,コンパイルするべきソースが間違っていたという,私の凡ミスです。
お騒がせしました。

ついでにもうひとつ,みなさんにお聞きしたいのですが,再起動をすると2,3回に
一回は起動に失敗してしまいます。
ラズパイ3は電源に敏感だと聞きましたが,pine64 もそうなのでしょうか。

私が使っているのは PINE A64+ 1GB BOARD で,OS は ubuntu です。
Linux pine64 3.10.105-0-pine64-longsleep #3 SMP PREEMPT Sat Mar 11 16:05:53 CET 2017 aarch64 aarch64 aarch64 GNU/Linux
(debian から ubuntu に入れ替えました。)