>>146
ご協力ありがとうございます。

1.XLaunchのコンフィグ
→プログラムの指定のみ分かりやすくするため
Program="$HOME/demo.sh" から
Program="firefox" へ変更していますが、
同様の現象が確認できています。
（以下、ベタ張りで見にくいかもしれませんが…）

<?xml version="1.0"?>
<XLaunch xmlns="http://www.straightrunning.com/XmingNotes"; xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance";
xsi:schemaLocation="http://www.straightrunning.com/XmingNotes XLaunch.xsd" WindowMode="MultiWindow"
ClientMode="StartProgram" Program="firefox" ClientStart="PuTTY" PW="demopass" RemoteHost="172.16.254.254"
RemoteUser="demouser" Display="0" Clipboard="true"/>

2.Puttyのバージョン
→現在はXming同梱版（Ver0.60）を利用していますが、
日本語化バージョン？（Ver0.63）等を利用しても、やはり同じでした。
Putty・Xmingの起動オプションもあさってみましたが
該当しそうなものが見つからずの状況です。