>>281
自己解決。
$ gst-launch-1.0 filesrc location=./100000.ts ! decodebin ! videoparse format=i420 width=1440 height=1080 framerate=30/1 ! vaapiencode_h264 ! avimux ! filesink location=test.avi

これでイケた。
decodebin のところを以下の様に置換したいんだけど、
どうやらできない模様(仕様なのかな)。

! tsparse ! mpegparse ! vaapidecode !

ちなみに、DVD画質(720x480 MPEG2)のエンコード速度(H264)は150FPSぐらい。
同じソースでMPEG2のエンコードだと200FPSくらい。

CPUは Intel(R) Core(TM) i7-4500U CPU @ 1.80GHz