会社で使うならCentOSでいいのでは？理由は、商用パッケージはRHELが対象だし、使える人も多いから。

逆に趣味や個人企業で、フリーな環境だけで完結する場合、しかも技術に自信があるならDebianがいいのでは？

昔自分も悩んで調べたけどスレは立てなかったなぁ・・・