追記です。
旧バージョンをご利用だった場合は、
初回起動時に旧バージョンのCookieを引き継ぐかを質問してきます。
引き継ぐ場合は、新バージョンでのCookieはなくなります（バックアップはされます）。
初回起動後にcookie.txtはcookie.bakにリネームされ、
引き継ぎを行った場合のCookieのバックアップはcookies.bakになります。
読みづらい長文失礼しました。