マザボを入れ換えして古いHDDをつないだまま
起動してしまってWinが起動できなかったんです。
（これは当たり前なんですが）
そんで新しいHDDを繋いでWinXPをインストールして
それから後日、スレーブにもう一台繋いだら、ドライブレターの
順序が変になってるんですが、直しようがないものなんでしょうか？

C:マスターのパーテーション１
D:スレーブ
E:マスターのパーテーション２
スレーブ側はパーテーションを切ってません。

もしかして、僕がマスターとスレーブのショートピンを
間違えているというオチなんでしょうか？