・開通直後でまだ不安定
・NUROの障害
・速度制限をくらってる
・人多すぎ
・同じ回線の奴の中にヘビーユーザーが混じってる
・パケ詰まりやら遅延やらで評判の悪いソネットのキャッシュサーバーの影響
・機器やケーブルの劣化(たまにある、特に停電の後)
・ルーターのセキュリティの過剰反応(再起動で直る場合がある)
・wi-fiなら電波干渉の可能性
・ウィルス対策ソフトなんかの影響(おまけでついてくるカスペは割と遅くしてる)

思いつくのはこのくらいか