マイナス宇宙で、製作側を匂わすシーンがあったから、マイナス宇宙＝現実世界ともとれないか？
そうなると、マイナス宇宙から戻れなかったシンジとマリが、ラストで向かいのホーム（アニメ内）の3人を見届けた後、実写の現実世界に駆け出すシーンも辻褄があう