吠えてる時に飼い主さんの方をチラチラ見ますか?それなら守る使命として吠えていると思います。
そうで無ければ恐怖からの威嚇吠えだと思います。
持論なので当てはまらないかも、ですが。
吠え出した時に手をパン!と叩いて、意識を飼い主さんの方に向けさせるのは?
意識を興奮の対象からそらすことが出来るようになれば良いのかも。