医学物理士は、現在では大学院か指定病院で養成されています。
http://www.jbmp.org/course_educational/decision/
大学院か大学病院での臨床研修生課程かです。
しかし医学部医学科で養成すればどうでしょうか？
医学部医学科4年を修了すると、

基礎医学研究→大学院へ進学
医師コース
医学物理士コース

に分かれるものとします。もちろんほとんどの学生は医師コースを選択するでしょう。医学物理士コースは主に学士編入とします。この方法ではどうでしょうか？