大分の別府大学にありますよ。
学科じゃないけど、芸術系の学科に、漫画・アニメーション専攻ってのがあります。

私もそこの生徒ですが、基礎から満遍なく学べるので楽しいです。
アニメや漫画中心に脚本の描き方や、映画についてなど、幅広くいろいろ学べます。

画力や技術面については、時間の都合上あまり勉強出来ませんので、
そういうのを勉強したい方は専門に行く方がおすすめかも。