>タイルのほうの工事が手間な感じがしますが安いのでしょうか？

値段はCFよりタイルのが高い

>それともフロアクッションクをはるスキルがないのでしょうか？

本人に聞いてみないと解らん
ただCF貼る自体特別難しい技術じゃないからなぁ
トイレなら一枚物でいけるだろうからジョイントもないだろうし