ツーバイのデメリットはルールガチガチで自由度が低い所。

耐震が多少弱くても、もっと自由な間取りにしたいみたいな事が法律上できない。
ルールに則って建てるだけで自動的に耐震等級3を遥かに上回る家が建つ。
それくらいツーバイのルールは過剰。