御祭神は、皇室の祖先神であり、日本人の総氏神としてあがめられる天照大御神（あまてらすおおみかみ）です。

荒祭宮は、天照大御神の積極的な側面である荒御魂をお祀りしています。

風日祈宮は、風雨を司る神、級長津彦命（しなつひこのみこと）、級長戸辺命（しなとべのみこと）をお祀りしています。