清掃までなら特に問題はないのです。
問題は鳥居や祠に素人が勝手に手を付けたことです。

これに関してスレ主が知識や経験を持っていなかったということでしょう。

そもそも自治会長が祠の所有者でないのであれば、違法行為にもなります。