>>594
まず、タイムゾーンが正しく設定されているか調べるべきだ

それで解決しなければOSが与えるタイムスタンプの粒度の問題じゃないかな
デフォルトでは秒の単位が一致していれば更新されていないとみなすんだが
オプション --modify-window に適当な値（単位は秒）を指定して、
わずかな時刻の差は無視するようにしてみては？