Gnome は MATE でも KDE にでも置き換え可能なので wayland 対応が進めば Gnome 捨てればいいんじゃね。
GTK の問題以外に Gnome 自体が他人が作った Extention を使えなくする方向で改修していくのがおかしくね？
Gnome 自体も最低限を開発するとかでもなく、スクリーンキャプチャ組み込んだり、ibus 組み込んでいって何だかなー、な感じ。