ごめん、調べたところ $ gnome-shell --replace
で再起動できるみたい　参考↓
https://qastack.jp/ubuntu/100226/how-to-restart-gnome-shell-from-command-line

仮想コンソールに落ちてログインしてからこのコマンドで、
それでも再起動しなかったらkillallしてから同じコマンドで
立ち上がってくれそう