音源のサンプルレートの再生にこだわる気持ちはよくわからないな
jackが周波数変換すると音源のサンプルレートの違いが消失すると思っているのか？
たとえばサンプルレートが44.1KHzの音源と96KHzの音源があったとすると
jackが192kHzで再生すると音質は96KHzの方が44.1KHzよりはるかに良い
そのうえ両方とも音質が向上している