>>90
サンクスです。
1:$s/\n\n\+/^M/g
で無事できました。

>>91
geanyのソースをちらっとみましたが、
src/search.cをみると検索にScintillaを使用していて、
正規表現検索時にはSCFIND_REGEXPとSCFIND_POSIXを
指定してるようなのですが、Scintillaの正規表現だと
$はいけても\nは使えないっぽいですねえ。