カギをショップに売ったとか？
ショップから買い戻せるよ
ショップに売っても、キャラが持ってなければまた拾えるけど

黒鉄の大鍵　1Fピットそばのワープゾーンの先
水晶の大鍵　1Fからロープで2Fに降りた先
石英の大鍵　2Fからロープで3Fに降りた先