376です。
今回の修理は全て示談で無償となりました。

まず親身にご相談に乗ってくださいました
ビシッと仕切るマハトマ・ファラオ・カメムシさん、
名無しの方ですが裁判などでアドバイスしてくださった方に
心より感謝いたします。ありがとうございます。

しかし今後の修理保証でかなり難航しているとのことです。
また壊れた場合どうするのか?
修理保証の期間や走行距離の条件は?

ディーラー側でもメーカーにお伺いを立てたり
新品のエンジンで対応するのか、新品よりも精度の高いリビルトで
対応するのか意見が交錯しているようです。

現状のままでエンジンを載せ替えて修理した場合
修理保証はつくのかつかないのか?

さらに納車前にディーラーで取り付けたオイルクーラーや
大型インタークーラー、エアインテークなどをノーマルに戻さなければ
修理保証はつけられないとの話も出ております。

社外部品を外すとなるとかなりの額の工賃です。
では過去の取り付け工賃やノーマルに戻す工賃は誰が負担するのか?
社外部品も無理やり取り付けさせたわけではなく
ディーラーが社外部品を発注し問題なく取り付けできると快諾して
取り付けた手前難しい問題です。もちろん車検対応品です。
工賃だけでも数十万単位です。

それか現状のままでエンジンを載せ替えて
有償で1年延長保証に入るか?入ることができるのか?

ディーラーでも全国規模で見ても
初めての事例で
意見がかなり交錯してるようです。