蛇足だけれども、核開発だけじゃないようだ。かの有名な陸軍中野学校も、2〜3系統あるうちの1つであったという説が。
もちろん、だからといって陸軍中野学校の地位が、B級的なものであったわけじゃない。中野は、戦争遂行のためには最も重要な、戦略系の一般普通の諜報員の養成機関(大正義、正統派、花形)であったらしい。まあ未確認情報だけれどねw

でも、たとえば内務省系の諜報機関とか、多系統ありそうだよなとは思うし、どこの国でも実は内戦こそが対外戦争よりも上位の真のシークレットで、常時緩やかな内戦を遂行してない国なんてないし、
軍は軍で内務省とは別で独立してなんかやっていてもまったく不思議じゃないどころかやっていてくれなきゃ困るし、
戦前にもエイリアンとか未来人とか並行世界人とかはいただろうし、南北朝正閏問題とか寺社勢力とか旧琉球王朝とかもあるし、
まあそういう訳だから、何かしらはあったんだろうなw