回答ありがとうございます。suexecをdisableにすれば動くという認識で大丈夫でしょうか？
また、修正です。
563行には、
ScriptAlias /nagios/cgi-bin/ /usr/local/nagios/sbin/
と記載してありました。
ちなみに、http://鯖IP と打つと正常に表示されますが、
http://鯖IP/nagios/とうつと、404エラー
You don't have permission to access /nagios/ on this server.
と返ってきてしまいます。
