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常識で分かるだろ。
X11を使わないことによって、リソース(メモリ、CPUの計算力)に
多少の余裕が生まれるから、リソース不足が原因だったらマシに
なるかも知れない。
ProFTPDのバグが原因なら、何をやっても無駄。

そもそも今時ftpを使っていること自体が非常識なんだが。
レンタルwebサービスなどでは、サポート費用が嵩むのを嫌って未だ
にftp使わせているようだがね。