個人で現実的、かつ実用的に運用できるのは次にあげる程度かと。
(情報の集めやすさ等も考慮)

・Windows2000 Professional (個人レベルでほとんどの場合、Serverは要らないかと)
・Linux (個人的なおすすめはDebian/GNU)
・FreeBSD / NetBSD

管理者のレベル(と好み)に応じて、適当なのを選ぶといいかと。

w2kproは、セキュリティホールは多く発見されるものの、
情報が集めやすいので下手に他のOSを選ぶよりも管理しやすい場合がある。

Linuxはディストリビューションにもよるけれど、おそらくPC-UNIXの中ではもっとも情報が集めやすい。
RedHatの標準設定は結構怪しいところがあるから、Debian/GNUで必要最小限の構成にするのがお勧め。
(RedHat 7.3インストール直後のApacheは穴だらけ)

FreeBSD/NetBSDは、Linuxほどでないにせよ情報が多い。
またLinuxのようなディストリビューションごとの微妙な差違がないため、
各種ソフトウェアが管理しやすい面もある。