目的別口座って定期の口数稼ぎ以外に、これは!! というメリットはあるのでしょうか?

たとえば、総合口座と違って
直接、引出や振込／振替が出来ないから、セキュリティ上安全だとか。
(総合口座に戻すのに再び認証が必要などで...)