以下URLが公式。多分。
http://taku910.github.io/mecab/
>>984 で再ビルドしたってのはソースを修正してmecabバイナリ群をリビルトしたという意味。
CreateFile()を呼び出している箇所は一ヶ所だけなので修正はさほど手間ではない。
開発者の方には、そろそろMecabの最新版を公式リリースしてもらいたい。64bit対応とかあるだろうし。
なお、Mecabの最終更新が2013-02-18と5年以上前。
Mecabに限らず、WSLとWindowsで同時にファイルを開くアプリは要注意。
Bzという割とメジャーなバリナリエディタもCreateFile()の共有指定がFILE_SHARE_READだけなので同じ現象が起きる。
この件、WSLの仕様がおかしいようにも思える。