mintは触ったこと無いから答えてやれないが・・・
プライマリパーティションがとか言うことはMBR系統だね
ブートローダーはgrubかな？
今言えることはLinuxを消した時にWindows10も起動できなくなるトラブルに
なりそうなのでMBR系統でデュアルブートする時はMBM等で２段式にしておくと良いよ
多分今の状態だとLinuxのブートローダー経由でWindows10を起動している可能性がある
ので下手にLinuxを消そうとしないことかな・・・