>>144
こちらの環境ではWinXPでもシステムトレイのXmingが終了せずWin7と同様の状態でした。

XLaunchからStart a programでXUbuntuのアプリケーションを直接指定しているので、
XWindow接続中もPuttyの画面が表示されておらず
アプリケーションウィンドウのみを閉じても、
裏で動作しているPuttyが終了していないのが原因だと考えています。

アプリケーションウィンドウが0になったときに
Puttyも同時に終了できればよいのですが…

Xming以外だとWeirdXと言うソフトも試してみたのですが
思った通りに動作せず、不具合も多いと聞くので
なんとかXmingで実現したいです。