文科省のサイトに不認可理由の公式コメントが載ったぞ。
http://www.mext.go.jp/b_menu/shingi/daigaku/toushin/05112501/002/002.htm
これを読む限り校舎だけが問題じゃなく、校舎問題がとどめを刺したって感じだな。